石英砂过滤器的清洗(Clean)与反冲洗(Backwash)是属于不同的操作目的，清洗(Clean)是在反冲洗(Backwash)效率下降的情况下所作的动作；而反冲洗(Backwash)是要排除过滤器内所捕捉的污染物质，使得过滤器的过滤功能可以持续的动作，以下分别说明如后：

石英砂过滤器的反冲洗(Backwash)的操作时机主要是依据单位时间的循环管线流量下降来判断过滤器的效能，在实务上则是以过滤器的压力上升来判断居多，即所谓的压差或水头损失。这是因为在池水的循环过滤当中，污染粒子被累积收集在石英砂的滤层当中，导致石英砂颗粒表面的增厚，进而阻碍水的流动，使得过滤器的压力升高，此时即需要借助反冲洗(Backwash)来排除所累积污染粒子，降低过滤器的压力，增加过滤流量；其主要的考虑因素是因为游泳池的过滤系统是属于循环式的过滤型态，它不仅要照顾到过滤效率的条件，也需要考虑到推动水流循环的能力，因此，水头损失的控制一般大都建议维持在0.5kg/cm　左右，也就是说，超过这个压差范围，过滤的水质虽然比较好，但是过滤出水却会减少，推力也不足，使得循环效率不佳，容易有死角，再加上泳客持续的污染，池水水质并不会因为此时的过滤而有所改善，反而会愈来愈糟；而低于这个压差范围，虽然水的循环次数增加，推力也够，但是过滤水质却不是很理想。况且，反冲洗的次数太频繁，会造成水资源的浪费；因此，从反冲洗后的过滤压力(初压)，加上0.5kg/cm2　(压差) 就是要作反冲洗的压力(末压)，亦即初压加上0.5kg/cm2即是要反冲洗的压力。

石英砂过滤器要清洗的原因是油脂的累积而不是砂层钙化，由于游泳池或按摩池的水中占有很多悬浮的人体脂质，这些脂肪质如果没有适当冲击处理时，会累积在石英砂颗粒的表面，使得石英砂对脂肪质的再排斥，进而脂肪质会继续往滤层的深处钻入，终至占满整个滤层，此时，脂肪质会因整体滤层的排斥而完全无法被过滤器所捕捉，池水就有微白，绿色甚至微黄色的混浊，即使反冲洗也无法改善水质，只好换水或更换滤材来解决问题。但是这种情形没有多久又重复出现，这类状况在高温池尤其容易发现。而市售的过滤器清洗剂则是针对这种情形所使用的药品，它是用来清洗滤材表面附着的有机脂质用的。当下列情况发生时，即是过滤器要清洗(Clean)的时候：

1)过滤器的反冲洗(Backwash)次数频繁，有效操作期间变短。

2)例行性反冲洗(Backwash)后过滤器初压无法下降。